Thomas LECOCQ

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Publications

2024

ACL - Articles comité de lecture référencés bases de données HCÉRES

• Early impact of domestication on aggressiveness, activity, and stress behaviors in zebrafish (Danio rerio) using mirror test and automated videotracking

  Scientific Reports, 14 (article), 21036, pp 1-14

  Diakos, E., Chevalier, C., Shahjahan, M.-D., Hardy, A., Lambert, S., Kestemont, P., Fontaine, P., Pasquet, A., Lecocq, T.

• Multi-genome comparisons reveal gain-and-loss evolution of anti-Mullerian hormone receptor type 2 as a candidate master sex-determining gene in Percidae

  BMC Biology, 22 (article), 141, pp. 1-17

  Kuhl, H., Euclide, P.T., Klopp, C., Cabau, C., Zahm, M., Lopez-roques, C., Iampietro, C., Kuchly, C., Donnadieu, C., Feron, R., Parrinello, H., Poncet, C., Jaffrelo, L., Confolent, C., Wen, M., Herpin, A., Jouanno, E., Bestin, A., Haffray, P., Morvezen, R., Rocha De Almeida, T., Lecocq, T., Schaerlinger, B., Chardard, D., ?arski, D., Larson, W.A., Postlethwait, J.H., Timirkhanov, S., Kloas, W., Wuertz, S., Stöck, M., Guiguen, Y.

• Stronger together: A workflow to design new fish polycultures

  Reviews in Aquaculture, Volume 16, Issue 3, pp. 1374-1394.

  Lecocq, T., Amoussou, N., Aubin, J., Butruille, G., Liarté, S., Pasquet, A., Thomas, M.

2022

• A multi-trait evaluation framework to assess the consequences of polyculture in fish production: An application for pikeperch in recirculated aquaculture systems

  Aquaculture Reports, 27, 101349.

  Amoussou, N., Lecocq, T., Fourrier, C., Nivelle, R., Fleck, C., Fontaine, P., Pasquet, A., Thomas, M.

• Finding the best match: a ranking procedure of fish species combinations for polyculture development

  Life, 12 (9), pp. 1315-1329.

  Amoussou, N., Thomas, M., Pasquet, A., Lecocq, T.

• AquaDesign: A tool to assist aquaculture production based on abiotic requirements of animal species

  PLoS ONE, 17 (8), pp. e0272508

  Butruille, G., Thomas, M., Pasquet, A., Amoussou, N., Toomey, L., Rosenstein, A., Chauchard, S., Lecocq, T.

• Signals of adaptation to agricultural stress in the genomes of two European bumblebees

  Frontiers in Genetics, 13 (-), pp. 993416--.

  Hart, A.F., Verbeeck, J., Ariza, D., Cejas, D., Ghisbain, G., Honchar, H., Radchenko, V., Straka, J., Ljubomirov, T., Lecocq, T., Dániel-ferreira, J., Flaminio, S., Bortolotti, L., Karise, R., Meeus, I., Smagghe, G., Vereecken, N., Vandamme, P., Michez, D., Maebe, K.

• All species matter: Comprehensive analysis of polyculture consequences on pikeperch (Sander lucioperca), sterlet (Acipenser ruthenus) and tench (Tinca tinca) in recirculated aquaculture system

  Aquaculture, 559. 738438

  Thomas, M., Amoussou, N., El Manfaloti, M., Fleck, C., Ledore, Y., Pasquet, A., Lecocq, T.

• Enrichment in a fish polyculture: Does it affect fish behaviour and development of only one species or both?

  Applied Sciences, 12 (7), 3674, pp.1-12

  Thomas, M., Reynaud, J-G., Ledore, Y., Pasquet, A., Lecocq, T.

• Assessing Genetic Variation in Wild and Domesticated Pikeperch Populations: Implications for Conservation and Fish Farming

  Animals, 12 (9), 1178. (pp. 1-16).

  Tsaparis, D., Lecocq, T., Kyriakis, D., Oikonomaki, K., Fontaine, P., Tsigenopoulos, C.

2021

• Resolving the species status of overlooked West?Palaearctic bumblebees

  Zoologica Scripta, 50 (5), pp. 616-632.

  Brasero, N., Ghisbain, G., Lecocq, T., Michez, D., Valterová, I., Biella, P., Monfared, A., Williams, P.H., Rasmont, P., Martinet, B.

• A workflow to design new directed domestication programs to move forward current and future insect production

  Animal Frontiers, 11 (3), pp. 69-77.

  Lecocq, T., Toomey, L.

• Global effects of extreme temperatures on wild bumblebees

  Conservation Biology, 35 (5), pp. 1507-1518.

  Martinet, B., Dellicour, S., Ghisbain, G., Przybyla, K., Zambra, E., Lecocq, T., Boustani, M., Baghirov, R., Michez, D., Rasmont, P.

• Mating under climate change: Impact of simulated heatwaves on the reproduction of model pollinators

  Functional Ecology, 35 (3), pp. 739-752.

  Martinet, B., Zambra, E., Przybyla, K., Lecocq, T., Anselmo, A., Nonclercq, D., Rasmont, P., Michez, D., Hennebert, E.

• When more is more: taking advantage of species diversity to move towards sustainable aquaculture

  Biological Reviews, 96 (2), pp. 767-784.

  Thomas, M., Pasquet, A., Aubin, J., Nahon, S., Lecocq, T.

• Split it up and see: using proxies to highlight divergent inter-populational performances in aquaculture standardised conditions

  BMC Ecology and Evolution, 21 (-), pp. 1-14, 206.

  Toomey, L., Dellicour, S., Kapusta, A., Zarski, D., Buhrke, F., Milla, S., Fontaine, P., Lecocq, T.

• Finding a rare gem: Identification of a wild biological unit with high potential for European perch larviculture

  Aquaculture, 530, 735807 (pp. 1-8).

  Toomey, L., Lecocq, T., Pasquet, A., Fontaine, P.

2020

• Taxonomic revision of the Sylvarum group of bumblebees using an integrative approach

  Systematics and Biodiversity, 18 (1), pp. 12-28.

  Brasero, N., Martinet, B., Michez, D., Lecocq, T., Valterová, I., Rasmont, P.

• Too strict or too loose? Integrative taxonomic assessment of Bombus lapidarius complex (Hymenoptera: Apidae)

  Zoologica Scripta, 49 (2), pp. 187-196.

  Lecocq, T., Biella, P., Martinet, B., Rasmont, P.

• The effects of polyculture on behaviour and production of pikeperch in recirculation systems

  Aquaculture Reports, 17 (1), 100333 (pp. 1-6).

  Thomas, M., Lecocq, T., Abregal, C., Nahon, S., Aubin, J., Jaeger, C., Wilfart, A., Schaeffer, L., Ledore, Y., Puillet, L., Pasquet, A.

• Getting off the right foot: Integration of spatial distribution of genetic variability for aquaculture development and regulations, the European perch case

  Aquaculture, 521, 734981 (pp. 1-11).

  Toomey, L., Dellicour, S., Vanina, T., Pegg, J., Kaczkowski, Z., Kouril, J., Teletchea, F., Blaha, M., Fontaine, P., Lecocq, T.

• Unlocking the intraspecific aquaculture potential from the wild biodiversity to facilitate aquaculture development

  Reviews in Aquaculture, 12 (4), pp. 2212-2227.

  Toomey, L., Fontaine, P., Lecocq, T.

• Comparison of single- and multi-trait approaches to identify best wild candidates for aquaculture shows that the simple way fails

  Scientific Reports, 10, 11564 (pp. 1-11).

  Toomey, L., Lecocq, T., Bokor, Z., Espinat, L., Ferincz, A., Goulon, C., Vesala, S., Baratcabal, M., Barry, M.D., Gouret, M., Gouron, C., Staszny, A., Mauduit, E., Mean, V., Muller, I., Schlick, N., Speder, K., Thumerel, R., Piatti, C., Pasquet, A., Fontaine, P.

Ouvrages

2021

OS - Ouvrages scientifiques

• A tutorial to design farming system for aquaculture (monoculture and polyculture) with AquaDesign

  Lecocq, T., Butruille, G.

Communications

2024

C-ACTI - Communications avec actes dans un congrès international

• Premières générations de domestication : comment le poisson zèbre (Danio rerio) évolue-t-il dans ce contexte particulier ?

  3nd Joint Congress on Evolutionary Biology, 26-30 juillet, Montréal, Canada

  Chevalier, C., Praion, M., Lambert, S., Ledore, Y., Lecocq, T., Shahjahan, M.-D., Silvestre, F., Milla, S., Schaerlinger, B.

• Combination must make strength: a workflow to design new fish polycultures

  AQUA2024, 26-30 août, Copenhague, Denmark

  Lecocq, T., Aubin, J., Thomas, M.

C-COM - Communications orales sans actes dans un congrès international ou national

• Concevoir de nouvelles stratégies de polyculture en étang

  Séminaire de l'Office National de la Biodiversité 'Les étangs piscicoles', 13-14 mars, Lyon, France

  Aubin, J., Thomas, M., Lecocq, T., Robin, J., Dupont, C., Tocqueville, A., Laithier, J., Pannard, A., Coudreuse, J., Roucaute, M., Jaeger, C., Wilfart, A., Maillot, M., Corson, M.

• Les étangs à la croisée de territorialités distinctes

  Séminaire national du Salon des Etangs, 19-21 avril, Parçay-Meslay, France

  Thomas, M., Lecocq, T., Dousset, S., Abildtrup, J., Durand, P.

C-AFF - Communications par affiche dans un congrès international ou national

• Comment le poisson zèbre, espèce modèle pour l’aquaculture, évolue-t-il lors de sa domestication ?

  8ème Journée de la Recherche, Filière Piscicole, 02-03 juillet, Rennes, France

  Chevalier, C., Praion, M., Ledore, Y., Lecocq, T., Silvestre, F., Schaerlinger, B., Milla, S.

• Gathering to serve: toff, a database on fish functional traits to promote the development of fish farming

  AQUA2024, 26-30 août, Copenhague, Denmark

  Lecocq, T., Benard, A., Pétronin, F., Thomas, M.

• How does domestication change the behaviour of the first generation of fish in captivity?

  AQUA2024, 26-30 août, Copenhague, Denmark

  Lecocq, T., Chevalier, C., Praion, M., Leclerc, T., Shahjahn, M.-D., Ledore, Y., Silvestre, F., Schaerlinger, B., Milla, S.

• In silico model to predict compatibility in fish polyculture

  AQUA2024, 26-30 août, Copenhague, Denmark

  Lévy, S., Thomas, M., Mortillaro, J.-M., Carval, D., Lecocq, T.

2023

C-ACTI - Communications avec actes dans un congrès international

• Développement d’un outil d’aide à la décision pour le choix d’associations d’espèces piscicoles en aquaculture

  7ème conference Panafrican Association on Fish and Fisheries, 18-22 septembre, Brazzaville, République du Congo

  Amoussou, N., Lecocq, T., Pasquet, A., Thomas, M.

• How can we optimise fish and plant diversity to improve pikeperch production in RAS and aquaponics?

  Aquaculture Europe 2023, Balanced Diversity in Aquaculture Development, 18-21 septembre, Vienne, Autriche

  Fontaine, P., Lecocq, T., Thomas, M.

• SEPURE: New strategies for the construction and management of pond production systems for sustainable fish farming

  Symposium for European Freshwater Sciences, 18-21 septembre, New Castle Upon Tyne, United Kingdom

  Girard, L., Aubin, J., Thomas, M., Lecocq, T., Robin, J., Tocqueville, A., Laithier, J., Pannard, A., Coudreuse, J., Roucaute, M., Jaeger, C., Wilfart, A., Latourre, Q., Maillot, M., Corson, M.

• Evaluating and selecting fish polyculture: having the big picture thanks to an integrative assessment

  Aquaculture Europe 2023, Balanced Diversity in Aquaculture Development, 18-21 septembre, Vienne, Autriche

  Thomas, M., Amoussou, N., Pasquet, A., Lecocq, T.

C-AFF - Communications par affiche dans un congrès international ou national

• How aquaculture potential changes during domestication: seeking the best way to maximize it

  Aquaculture Europe 2023, Balanced Diversity in Aquaculture Development, 18-21 septembre, Vienne, Autriche

  Diakos, E., Fontaine, P., Lecocq, T.

• Investigating the potential of a multi-function selective breeding from the onset of domestication

  Aquaculture Europe 2023, 18-21 septembre, Vienna, Austria

  Diakos, E., Fontaine, P., Lecocq, T.

• Behavioral comparison among wild and domesticated zebrafish strains: effects of domestication

  Aquaculture Europe 2023, Balanced Diversity in Aquaculture Development, 18-21 septembre, Vienne, Autriche

  Diakos, E., Pasquet, A., Hardy, A., Chevalier, C., Fontaine, P., Lecocq, T.

C-ED/RES - Communication de type ED ou diffusion restreinte

• Les étangs en Lorraine : un héritage du passé pour quels services écosystémiques aujourd’hui ?

  Séminaire annuel de la Zone Atelier Moselle, 14-15 juin, Vittel, France

  Thomas, M., Lecocq, T.

• La Plateforme Expérimentale en Aquaculture dédiée à la recherche, la formation et l’innovation pour l’aquaculture de demain

  Première rencontre du Réseau des Animaleries du Grand Est, 16 juin, NANCY, France

  Thomas, M., Lecocq, T.

• L’agroécologie appliquée au développement de la polyculture

  Séminaire INRAE, Recherche Modèle Poissons, 26-27 janvier, Rennes, France

  Thomas, M., Pasquet, A., Lecocq, T.

2022

C-ACTI - Communications avec actes dans un congrès international

• Providing new solutions of fish stocking for freshwater pond systems in France

  Aquaculture Europe, 27-30 septembre, Rimini, Italie

  Aubin, J., Thomas, M., Lecocq, T., Robin, J., Dupont, C., Tocqueville, A., Laithier, J., Pannard, A., Coudreuse, J., Roucaute, M., Jaeger, C., Wilfart, A., Maillot, M., Corson, M.S.

C-COM - Communications orales sans actes dans un congrès international ou national

• La compartimentation des étangs favorise-t-elle la productivité piscicole ?

  7èmes Journées de la Recherche de la Filière Piscicole, 05-06 juillet, Paris, France

  Jaeger, C., Roucaute, M., Wilfart, A., Latourre, Q., Maillot, M., Corson, M., Gallard, A., Joseph, B., Bennevault, Y., Coké, M., Azam, D., Thomas, M., Lecocq, T., Robin, J., Toqueville, A., Laithier, J., Pannard, J., Coudreuse, J., Aubin, J.

C-AFF - Communications par affiche dans un congrès international ou national

• SEPURE : De nouvelles solutions d'empoissonnement pour les étangs en France

  7èmes Journées de la Recherche de la Filière Piscicole, 05-06 juillet, Paris, France

  Aubin, J., Thomas, M., Lecocq, T., Robin, J., Tocqueville, A., Laithier, J., Pannard, A., Coudreuse, J., Roucaute, M., Jaeger, C., Wilfart, A., Latourre, Q., Maillot, M., Corson, M.

2021

C-ACTI - Communications avec actes dans un congrès international

• Development of an in silico method to design new species polyculture in aquaculture

  Aquaculture Europe 2021, 05-08 octobre, Madère, Portugal

  Amoussou, N., Lecocq, T., Pasquet, A., Thomas, M.

• Unlocking the wild potential: integration of geographic differentiation in domestication processes to facilitate aquaculture diversification

  Aquaculture Europe 2021, 05-08 octobre, Madère, Portugal

  Lecocq, T., Toomey, L., Fontaine, P.

Masters - Thèses - HDR

2023

HDR

• Utiliser et façonner la biodiversité ichtyologique pour faciliter la diversification de l’aquaculture

  Lecocq, T.

Masters

• Strains and successive generations affect behaviors in zebrafish (Danio rerio)

  Hardy, A.; Pasquet. A.; Diakos, E., Lecocq, T.

2022

Thèses

• Toward sustainable fish farming by developing a new prospective integrative approach to design fish community in aquaculture

  Amoussou, N., Lecocq, T., Thomas, M.

Masters

• Conséquences comportementales de la polyculture piscicole sur les relations interindividuelles inter et intra-spécifiques : un problème pour le bien-être animal ?

  Bled, A., Pasquet, A., Lecocq, T.

• Effet de la densité sur les relations intra et interspécifiques dans une polyculture de poissons en élevage intensif

  Hardy, A., Lecocq, T., Pasquet, A., Thomas, M.

2021

• Developing a tool to assist aquaculture production design based on abiotic requirements of animal species

  Butruille, G., Thomas, M., Lecocq, T.

• Conséquences comportementales de la polyculture sur les relations interindividuelles aux niveaux intra- et interspécifiques

  El manfaloti, M.A., Thomas, M., Pasquet, A., Lecocq, T.

2020

Thèses

• Unlocking the wild potential : integration of geographic differentiation in domestication processes to facilitate fish aquaculture diversification

  Toomey, L., Fontaine, P., Lecocq, T.