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RP2E INRA Université de Lorraine

Productions scientifiques Aquaculture

GCALIGNER 1.0: an alignment program to compute a multiple sample comparison data matrix from large eco-chemical datasets obtained by GC.

Journal of separation science, 36 (19), pp. 3206-3209.

Dellicour, S., Lecocq, T.

2013

GCALIGNER 1.0 is a computer program designed to perform a preliminary data comparison matrix of chemical data obtained by GC without MS information. The alignment algorithm is based on the comparison between the retention times of each detected compound in a sample. In this paper, we test the GCALIGNER efficiency on three datasets of the chemical secretions of bumble bees. The algorithm performs the alignment with a low error rate (<3%). GCALIGNER 1.0 is a useful, simple and free program based on an algorithm that enables the alignment of table-type data from GC.

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